Герб города Губкинского внесен в Регистр Государственной герольдии при Президенте Российской Федерации за №480.

Муниципальный герб города Губкинского представляет собой щит, разделенный на серебряное и красное поля голубой волнообразной перевязью, скошенной слева. В серебряном поле в верхнем правом углу щита – черная капля, соединенная с голубой, символизирующие нефть и газ. В красном поле в нижнем левом углу – возникающий золотой орнамент в виде стилизованных рогов оленя (статья 2 Приложения к решению Городской Думы от 29 мая 2006 года № 78 «Об утверждении Положения об официальных символах муниципального образования город Губкинский»)

Флаг города Губкинского внесен в Регистр Государственной герольдии при Президенте Российской Федерации за №481. Флаг города Губкинского представляет собой прямоугольное полотнище с отношением высоты к длине 2:3. Полотнище разделено волнистой лазоревой перевязью. Вверху в серебряном поле падающая косвенно слева черная капля, сверху окаймленная двойной каймой широкой голубой снаружи и узкой золотой внутри, внизу червленое и золотое поле скошено малыми стропилами.

Примененные во флаге цвета повторяют символику флага Российской Федерации и флага Ямало-Ненецкого автономного округа.

Голубой цвет преобладает во флаге, так как он одновременно символизирует голубое небо и бесконечные водные просторы. Возникающий золотой орнамент в виде стилизованных рогов оленя на красном поле – традиционный орнамент в культуре народов Севера.

Расположенная в верхнем левом углу полотнища черная капля, обремененная возникающей голубой, символизирует нефть и газ – природные богатства, которым город обязан своим рождением.

Флаг разработан в соответствии с существующим гербом города (статья 3 Приложения к решению Городской Думы от 29 мая 2006 года № 78 «Об утверждении Положения об официальных символах муниципального образования город Губкинский»)